iPhoneの上部に、マイナンバーカードの中心を押し当てて動かさずに、しばらくお待ちください。
なお、iPhoneのケースを外すと、さらに読み取りやすくなるので、お試しください。
詳しい位置等はこちら（ https://www.jpki.go.jp/faq/trouble/nfc/iphonefaq.pdf ）をご覧ください。