保険医療機関・保険薬局の窓口で支払う医療費の金額は、10円単位で算出していますが、一方、「医療費通知情報」は１円単位で記載されることがあるため、「医療費通知情報」上の窓口負担相当額と窓口で実際に支払った医療費の金額が異なる場合があります。この場合、「医療費通知情報」に記載された窓口負担相当額に基づいて医療費控除の額を計算して差し支えありません。また、医療機関等の窓口で実際に支払った金額により医療費控除の額を計算しても差し支えありません。
ただし、その他に、公費負担医療制度や減額査定等の情報が医療費通知情報に反映されない場合があります。その際には、該当する医療費につき、お手元の領収書等をご確認いただき、実際に支払った医療費の金額や補てんされる金額を入力することにより、実際に負担した医療費の金額で医療費控除の額を計算いただきますようお願いいたします。