e-Taxのメッセージボックスは、マイナポータルのメニューから「外部サイトとの連携」より、e-Taxにログインしていただくことでご確認いただけます。
ご参考として下記のe-TaxHPをご確認ください。

●e-Tax　「税務署からのお知らせ」等のメールが届いた方へ
https://www.e-tax.nta.go.jp/topics/topics_oshirase_mail.htm

なお、e-Taxに関するお問い合わせについては、下記ページをご参照ください。
■チャットボット「税務職員ふたば」
https://www.nta.go.jp/taxes/shiraberu/chatbot/index.htm

■確定申告期に多いお問合せ事項Q&Ａ
https://www.nta.go.jp/taxes/shiraberu/shinkoku/qa/01.htm

■e-Tax　お問い合わせ先
http://www.e-tax.nta.go.jp/toiawase/toiawase.htm