Android端末からiPhoneに機種変更を行う場合は、Android端末に登録していたスマホ用電子証明書は引き継ぐことはできません。機種変更後のiPhoneから、iPhoneのマイナンバーカードの追加を行ってください。

iPhoneのマイナンバーカードの追加方法については、下記デジタル庁のホームページからご確認ください。

●デジタル庁 サービス紹介サイト：マイナンバーカードをiPhoneに追加する
https://services.digital.go.jp/mynumbercard-iphone/add/

また、Android端末に登録していたスマホ用電子証明書を失効する場合は、iPhoneのマイナンバーカードを追加する手続きの中で実施できます。
失効申請中にAndroid端末が下記の状態になっていれば、Android端末からスマホ用電子証明書が失効されます。

・インターネット通信に接続されている
・電源が入っている
・スマートフォンの画面がオンになっている
・省電力モードになっていない
・出荷時リセットがされていない

なお、使用していたAndroid端末を売却、譲渡または修理する場合など、Android端末のスマホ用電子証明書を確実に失効したい場合においても、使用していたAndroid端末を上記の状態にして失効申請を行ってください。