マイナポータルから届け出た氏名フリガナは、審査を行った本籍地の市区町村から指摘を受け、「氏名の振り仮名の届出」画面の該当する氏名フリガナの届出に「確認事項あり」と表示された場合のみ、引き続きマイナポータルを利用して修正することができます。

やむを得ない理由で届出内容を修正したい場合は、届出が受理される前に、届け出た市区町村の窓口へ取下げの意思がある旨を連絡し、届出を取り下げていただいた上で、再度初回から届出をやり直してください。

氏名フリガナの届出の取下げ方法については、以下の操作マニュアルをご確認ください。
●操作マニュアル　05 戸籍のフリガナの届出を取り下げる
https://img.myna.go.jp/manual/03-17/0247.html

なお、氏名の振り仮名の届出が受理され、戸籍に登録された氏名フリガナの修正を行う場合は、家庭裁判所の許可が必要であり、マイナポータルでは対応できません。